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面包小麦基因组

时间:2018-12-17 05:43  来源:未知  阅读次数: 复制分享 我要评论

  来自约翰斯霍普金斯大学,承平洋生物科学和厄勒姆研究所的国际科学家团队为通俗面包小麦(Triticum aestivum)制造了第一个近乎完整的基因组序列。该研究颁发在GigaScience期刊上。

  面包小麦具有科学上已知的最复杂的基因组之一,具有6个拷贝的7个染色体,大量分离的几乎不异的序列,而且总体大小为近160亿个碱基对DNA。

  比拟之下,人类基因组大约小5倍,具有约30亿个碱基对和23个染色体的两个拷贝。

  “颠末多年的勤奋,我们终究可以或许出产出这种极具挑战性的基因组的高质量拆卸,”约翰霍普金斯大学工程与医学院的Steven Salzberg传授说。

  以前颁发的面包小麦基因组版本在其高度反复的DNA序列中含有大的空白。

  “这种基因组的反复性使其难以完全测序。这就像试图用庞大的蓝天拼集一个景观场景的拼图游戏。有很多很是类似,小块的拆卸,“萨尔茨伯格传授说。

  新拆卸的面包小麦基因组用了一年的时间让该团队将1.5万亿根本原始数据拆卸成153.3亿个碱基对的最终拆卸。

  为此,作者利用了两种基因组测序手艺:高通量短读序列和长读,单分子测序。

  “顾名思义,高通量测序能够很是快速和廉价地发生大量的DNA碱基对,虽然这些片段很是短 - 这个项目只需150个碱基对,”研究人员注释说。

  “为了协助拆卸反复区域,我们利用了及时的单分子测序,它能够读取DNA,由于它是在芯片上的细小纳米级孔中合成的。该手艺使我们可以或许通过丈量复制每个DNA碱基时发出的荧光信号,一次读取多达20,000个碱基对。

  新拆卸的面包小麦基因组序列和比来发布的面包小麦先人序列,Tausch的山羊草(Aegilops tauschii),能够协助生物学家不只更好地领会小麦的进化汗青,并且还能够推进对小麦的追求。 ,更多抗虫害和抗旱的小麦类型,以协助养活世界不竭增加的生齿。管家婆网站免费计划

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